Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SEBOXQ9HB31 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SEBOXQ9HB31 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SEBOXQ9HB31 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SEBOXQ9HB31 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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SEBOXQ9HB31 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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SEBOXQ9HB31 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SEBOXQ9HB31 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SEBOXQ9HB31 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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