Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC2Q9H6S0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC2Q9H6S0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms