Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRCC1Q9C099 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms