Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM4Q9C037 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms