Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms