Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms