Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms