Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms