Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4AQ9BY43 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms