Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms