Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms