Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RTKNQ9BST9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms