Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GORASP1Q9BQQ3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GORASP1Q9BQQ3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms