Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLF1Q9BQI6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms