Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms