Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP1Q96S65 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms