Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TEFMQ96QE5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms