Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSSK3Q96PN8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms