Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf72Q96LT7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms