Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SENP8Q96LD8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms