Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms