Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LIN37Q96GY3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms