Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms