Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms