Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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FAM3DQ96BQ1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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FAM3DQ96BQ1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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