Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms