Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms