Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms