Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEMA4DQ92854 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms