Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms