Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms