Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms