Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC150Q8NCX0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms