Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms