Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD53Q8N9V6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms