Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms