Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2BQ8N4Y2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms