Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD35Q8N283 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms