Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ4

LRP11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP11Q86VZ4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRP11Q86VZ4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP11Q86VZ4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms