Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms