Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms