Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF23Q7RTU1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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