Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms