Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms