Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOM1L2Q6ZVM7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms