Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM72Q6ZMU5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM72Q6ZMU5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms