Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms