Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms