Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms