Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms